《玛丽·塞利斯特的秘密》拥有很强的悬念性，画面真实自然，人物形象刻画入微。贯穿整部影片的悬念到最后才得以解开。导演以细致的人物心理刻画，使得这部经典影片即便在当今看来，也绝对让人匪夷所思！
玛丽·塞利斯特号商船满载货物准备离开纽约港前去意大利，船长本杰明要妻子萨拉一同前往，本杰明向萨拉描绘了大海的美丽，红色的黎明，成群的白帆和美妙的夜晚。本杰明的描绘彻底消除了萨拉对出海远行的恐惧。
另一只商船的吉姆船长也爱着萨拉，他和本杰明原是好友，因同时爱上萨拉而不欢而散。商船将要启航，水手不够，本杰明找吉姆帮忙，吉姆不怀好意的派人上了“玛丽”号，他要本杰明到不了目的地。船员安顿和“玛丽”号副船长威尔逊有过节，他也随同商船一起出发了。海上起了风暴，商船在暴风雨中飘摇，有船员葬身海底，安顿告诉萨拉，商船起航就潜藏着危险，注定有死亡，萨拉感到非常害怕，接着发生的事情更是令她心惊胆颤，船员一个接着一个被杀，死亡笼罩着“玛丽”号，本杰明船长和萨拉也失踪了，只有威尔逊和安顿活着。真相终于大白，这一切都是安顿为了报复造成的，安顿开枪打死了威尔逊，自己也神智不清的跳入大海。吉姆的商船发砚了在海上漂流的“玛丽”号，可是船在无人。